Poligeny, przewidywanie ryzyka i ukierunkowane zapobieganie rakowi piersi

Omawiając poligenikę i raka piersi, Pharoah et al. (Wydanie 26 czerwca) nie wspominając o opłacalności. Jeśli weźmiemy 3% za zmniejszenie całkowitego obciążenia chorobami oszacowane przez Pharoah et al. i zastosować go do obliczonego wzrostu oczekiwanej długości życia o 0,6 roku, jeśli wszystkie nowotwory piersi zostaną wyeliminowane, 2 aktualne testy poligeniczne zwiększyłyby średnią długość życia o zaledwie tydzień dla całej populacji płci żeńskiej.
Chociaż zysk jest niewielki, stosunkowo niski koszt wdrożenia podejścia wielogenowego czyni go atrakcyjnym, gdy weźmie się pod uwagę szacowane dodatkowe lata życia skorygowane o jakość (QALY). Nawet kompleksowe skanowanie w całym genewewidzie zawierające 500 000 markerów kosztuje teraz tylko 1000 USD, więc używając danych dotyczących oczekiwanej długości życia w zależności od stanu zdrowia, 2 z nich kosztuje 67 000 USD na dodatkowy QALY. Jest to korzystniejsze w porównaniu z innymi podejściami do poprawy przeżywalności u pacjentów z rakiem piersi4 iz pewnością stanie się bardziej korzystne, ponieważ koszty skanowania genomu gwałtownie spadają, więcej genów ryzyka jest udokumentowanych, a wielu lekarzy używa skanów genomu.
Richard J. Wilkins, Ph.D.
University of Waikato, Hamilton 3240, Nowa Zelandia
re. ac.nz
4 Referencje1. Pharoah PD, Antoniou AC, Easton DF, Ponder BA. Poligeny, przewidywanie ryzyka i ukierunkowane zapobieganie rakowi piersi. N Engl J Med 2008; 358: 2796-2803
Bezpłatny, pełny tekst Web of Science Medline
2. Manuel DG, Luo W, Ugnat AM, Mao Y. Przyczyna – skorygowana długość życia skorygowana ze względu na stan zdrowia Kanadyjczyków z wybranymi chorobami przewlekłymi. Chronic Dis Can 2003; 24: 108-115
Medline
3. Feero WG, Guttmacher AE, Collins FS. Genom staje się osobisty – prawie. JAMA 2008; 299: 1351-1352
Crossref Web of Science Medline
4. Stout NK, Rosenberg MA, Trentham-Dietz A, Smith MA, Robinson SM, Fryback DG. Retrospektywna analiza opłacalności mammografii przesiewowej. J Natl Cancer Inst 2006; 98: 774-782
Crossref Web of Science Medline
Pharoah i in. doszli do wniosku, że profil ryzyka genetycznego poprawi populacyjne programy interwencji w przypadku raka sutka . Zakładali, że w genomie są dwie kopie każdego locus i że ryzyko związane z siedmioma wrażliwymi na raka allelami zależy od dawki allelu. . Ocenili również względne ryzyko raka piersi przy użyciu multiplikatywnego modelu interakcji między siedmioma powszechnymi allelami podatności. Nie wzięli jednak pod uwagę efektu zmian liczby kopii. Ponadto trzy z siedmiu alleli znajdują się w regionach o zmienności liczby kopii (http://projects.tcag.ca/variation/); w przypadku dwóch z nich zidentyfikowano utratę kopii w kontrolach HapMap. Dlatego liczba możliwych kombinacji jest wyższa niż oszacowano, a ryzyko względne powinno zostać ponownie ocenione. Wykazano, że zmiany liczby kopii są związane z powszechnymi zaburzeniami1 i odpowiedzialne za różnice w ekspresji genów.2 Chcielibyśmy podkreślić trudność stratyfikacji ludzi w zależności od ryzyka genetycznego i złożoności integracji różnych rodzajów zmian genetycznych w model statystyczny obecnie.
Luis Teixeira, MD
Hôpital Saint-Louis, 75010 Paryż, Francja
luis fr
Cedric Julien, Ph.D.
INSERM Unité 567, 75014 Paryż, Francja
Fabien Guimiot, Ph.D.
Hôpital Robert Debré, 75019 Paryż, Francja
2 Referencje1. Estivill X, Armengol L. Warianty liczby kopii i typowe zaburzenia: wypełnianie luk i badanie złożoności w badaniach asocjacyjnych całego genomu. PLoS Genet 2007; 3: 1787-1799
Crossref Web of Science Medline
2. Stranger BE, Forrest MS, Dunning M, i in. Względny wpływ zmienności liczby nukleotydów i liczby kopii na fenotypy ekspresji genów. Science 2007; 315: 848-853
Crossref Web of Science Medline
Pharoah i in. raport dotyczący siedmiu polimorficznych markerów ryzyka raka piersi replikowanych w badaniach dotyczących asocjacji genomewidu. Chociaż dobrze wiadomo, że przypadki raka piersi przed menopauzą i po menopauzie mają różne czynniki ryzyka, te przypadki analizowano jako jedną grupę. Polimorfizmy mogą zmieniać ekspresję genów, ale ekspresja jest również regulowana przez czynniki środowiskowe, które mogą prowadzić do zmian epigenetycznych1. Wielkość modyfikacji ryzyka może być błędnie obliczona, gdy pacjenci przed menopauzą i po menopauzie są łączeni i nie są brane pod uwagę dane ankietowe dotyczące istotnych czynników ryzyka środowiskowego. Na przykład ochronne działanie kawy z kofeiną na dziedziczny i sporadyczny rak piersi wydaje się być znaczące, ale ograniczone do kobiet z allelem CYP1A2 * 1FC. CYP1A2 jest kluczowym enzymem w metabolizmie kofeiny i estrogenu.4 Jest biologicznie wiarygodny. że różne kombinacje czynników genetycznych i nieenzymatycznych (np. kawa), które regulują ekspresję CYP1A25, w różny sposób wpływają na ryzyko. Łączenie danych z kwestionariuszy i badań stowarzyszeń genomewidu, w których stratyfikowane są pacjenci przed menopauzą i po menopauzie, może dostarczyć lepszych szacunków ryzyka dla selekcji kobiet w celu badania przesiewowego.
Helena Jernström, Ph.D.
Uniwersytet w Lund, SE-221 85 Lund, Szwecja
Helena. lu.se
5 Referencje1. Waterland RA, Michels KB. Epigenetyczna epidemiologia hipotezy o pochodzeniu rozwojowym. Annu Rev Nutr 2007; 27: 363-388
Crossref Web of Science Medline
2. Kotsopoulos J, Ghadirian P, El-Sohemy A, i in. Genotyp CYP1A2 modyfikuje związek między konsumpcją kawy a ryzykiem raka piersi wśród nosicieli mutacji BRCA1. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2007; 16: 912-916
Crossref Web of Science Medline
3. Bageman E, Ingvar C, Rose C, Jernstrom H. Zużycie kawy i genotyp CYP1A2 * 1F modyfikują wiek w diagnostyce raka piersi i statusu receptora estrogenu. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2008; 17: 895-901
Crossref Web of Science Medline
4. Lee AJ, Cai MX, Thomas PE, Conney AH, Zhu BT. Charakterystyka utleniających metabolitów 17.-estradiolu i estronu utworzonego przez 15 selektywnie eksprymowanych ludzkich izoform cytochromu p450. Endocrinology 2003; 144: 3382-3398
Crossref Web of Science Medline
5. Djordjevic N, Ghotbi R, Bertilsson L, Jankovic S, Aklillu E. Indukcja CYP1A2 przez duże spożycie kawy u Serbów i Szwedów. Eur J Clin Pharmacol 2007; 64: 381-385
Crossref Web of Science Medline
Powołanie się na artykuł (1)
[podobne: amyloza, zaburzenia troficzne, elastopatia ]